diff --git a/include/igl/adjacency_list.cpp b/include/igl/adjacency_list.cpp
index dfc94be2f..d1d43e0c7 100644
--- a/include/igl/adjacency_list.cpp
+++ b/include/igl/adjacency_list.cpp
@@ -12,7 +12,7 @@
 
 template <typename Index, typename IndexVector>
 IGL_INLINE void igl::adjacency_list(
-    const Eigen::PlainObjectBase<Index>  & F,
+    const Eigen::MatrixBase<Index>  & F,
     std::vector<std::vector<IndexVector> >& A,
     bool sorted)
 {
@@ -161,9 +161,9 @@ IGL_INLINE void igl::adjacency_list(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
-template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, int>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
+template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
 // generated by autoexplicit.sh
-template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, int>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
-template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3>, int>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
-template void igl::adjacency_list<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, unsigned int>(class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const &, class std::vector<class std::vector<unsigned int, class std::allocator<unsigned int> >, class std::allocator<class std::vector<unsigned int, class std::allocator<unsigned int> > > > &, bool);
+template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
+template void igl::adjacency_list<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&, bool);
+template void igl::adjacency_list<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, unsigned int>(class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const &, class std::vector<class std::vector<unsigned int, class std::allocator<unsigned int> >, class std::allocator<class std::vector<unsigned int, class std::allocator<unsigned int> > > > &, bool);
 #endif
diff --git a/include/igl/adjacency_list.h b/include/igl/adjacency_list.h
index 7438cde42..e674f0e2d 100644
--- a/include/igl/adjacency_list.h
+++ b/include/igl/adjacency_list.h
@@ -31,7 +31,7 @@ namespace igl
   // See also: edges, cotmatrix, diag
   template <typename Index, typename IndexVector>
   IGL_INLINE void adjacency_list(
-    const Eigen::PlainObjectBase<Index> & F, 
+    const Eigen::MatrixBase<Index> & F, 
     std::vector<std::vector<IndexVector> >& A,
     bool sorted = false);
 
diff --git a/include/igl/boundary_loop.cpp b/include/igl/boundary_loop.cpp
index 9a3ec625e..11802cd72 100755
--- a/include/igl/boundary_loop.cpp
+++ b/include/igl/boundary_loop.cpp
@@ -14,7 +14,7 @@
 
 template <typename DerivedF, typename Index>
 IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF> & F,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedF> & F,
     std::vector<std::vector<Index> >& L)
 {
   using namespace std;
@@ -91,7 +91,7 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
 
 template <typename DerivedF, typename Index>
 IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F,
   std::vector<Index>& L)
 {
   using namespace Eigen;
@@ -130,7 +130,7 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
 
 template <typename DerivedF, typename DerivedL>
 IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedL>& L)
 {
   using namespace Eigen;
@@ -149,5 +149,5 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
-template void igl::boundary_loop<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::boundary_loop<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 #endif
diff --git a/include/igl/boundary_loop.h b/include/igl/boundary_loop.h
index ebb5072a5..f60ff7098 100755
--- a/include/igl/boundary_loop.h
+++ b/include/igl/boundary_loop.h
@@ -25,7 +25,7 @@ namespace igl
   //
   template <typename DerivedF, typename Index>
   IGL_INLINE void boundary_loop(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F, 
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F, 
     std::vector<std::vector<Index> >& L);
 
 
@@ -41,7 +41,7 @@ namespace igl
   //
   template <typename DerivedF, typename Index>
   IGL_INLINE void boundary_loop(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F, 
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F, 
     std::vector<Index>& L);
 
   // Compute ordered boundary loops for a manifold mesh and return the 
@@ -56,7 +56,7 @@ namespace igl
   //
   template <typename DerivedF, typename DerivedL>
   IGL_INLINE void boundary_loop(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F, 
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F, 
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedL>& L);
 }